A seguito di un sacrificio, la banda composta da Hunter, Wrecker, Crosshair si sfilaccia quando Omega viene portata sul monte Tantiss, in una base dell'Impero. Le nuove puntate iniziano dalla ricerca della stessa Omega parte della Clone Force 99, o di ciò che ne rimane, affrontando un Impero via via più strutturato, per arrivare a quello che poi vedremo nella trilogia cinematografica di George Lucas. Per salvare Omega, e per salvare se stessi, dovrAnno affrontare anche un gigantesco Sarlacc, la Clone Force 99 dovrà scendere a compromessi anche legandosi a personaggi controversi, intanto che Omega, ancora più centrale nell'economia del racconto, comprenderà la sua vera natura di ragazza clone. The Bad Batch sintetizza al meglio lo spirito di Star Wars: umorismo, emozioni, azione, ragione. Suddivisa in quindici episodi, The Bad Batch 3, prendendosi i suoi spazi, in una Trama tanto elaborata quanto verticale, nonché colma di presenze interessanti, riesce a tenere alta l'attenzione, mantenendo lo spirito intatto lo spirito ribelle della Clone Force 99.